1ـ همكاري ,‌پيگيري و اجراي كليه بخشنامه هاي و دستورالعملهاي دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان و كليه گروه هاي تخصصي آن در سازمان مركزي و عنداللزوم ابلاغ آن به زير مجموعه هاي شهرستان تابعه
2ـ شناسايي مراكز تكثير و پرورش انواع آبزيان در سطح استان به تفكيك سيستمهاي مختلف پرورشي , ثبت و جمع آوري كليه اطلاعات آماري در هر دوره پرورشي با همكاري زير مجموعه ها در شهرستانهاي تابعه
3ـ انجام كليه وظائف محوله زير مجموعه هاي شهرستان تابعه در صورت عدم تشكيل و يا نبود ايشان
4ـ جمع آوري اطلاعات و آمار مزارع تكثير و پرورش انواع آبزيان در سطح شهرستانهاي تابعه و تدوين گزارشات و ادواري مربوطه جهت ارسال به دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان مركزي.
5ـ تهيه و تنظيم و اجراي برنامه هاي پيشگيري و مبارزه منطقه اي با بيماريهاي عفوني (ميكروبي, ويروسي , انگلي و قارچي) و غير عفوني مزارع تكثير و پرورش انواع آبزيان استان با هماهنگي هاي لازم دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان مركزي
6ـ اجراي برنامه ها و پروژه هاي ملي پيشگيري و مبارزه با بيماريهاي عفوني( ميكروبي, ويروسي ,‌انگلي و قارچي) و غير عفوني مزارع تكثير و پرورش انواع آبزيان با هماهنگي هاي لازم و نظارت هاي مستقيم دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان مركزي.
7ـ سركشي, بازديد, نمونه برداري و انجام آزمايشات لازم بطور منظم و بمنظور كنترل و ريشه كني بيماريهاي ميكروبي , ويروسي , انگلي و قارچي بومي مزارع تكثير و پرورش انواع آبزيان استان با هماهنگي هاي لازم دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان مركزي.
8ـ اجراي برنامه هاي لازم بمنظور جلوگيري از سرايت بيماريهاي واگير غير بومي استان با همكاري ساير استانها خصوصاً مناطق همجوار ونظارت مستقيم دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان دامپزشكي كشور.
9ـ انجام مطالعات لازم و همكاري با موسسات تحقيقات , دانشگاهها منطقه.
10ـ برآورد و پيگيري تهيه داروها , سموم واكسنها و واد بيولوژيك لازم منطقه با توجه به نوع سيستمها و آبزيان استان
11ـ كسب آخرين اطلاعات علمي و فني از منابع داخلي وخارجي در مورد مبارزه و ريشه كني بيماريهاي واگيردار مطالعه و تحقيق در خصوص بيماريهاي نوظهور,‌تحقيق و مطالعه بمنظور كنترل و ريشه كني اين بيماريها
12ـ تهيه طرحها و پروژه هاي بلند مدت و كوتاه مدت استاني در زمينه بهداشت و كنترل بيماريهاي مزارع تكثير و پرورش انواع آبزيان استان منطبق با سياستهاي دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان دامپزشكي كشور.
13ـ اجراي برنامه قرنطينه اي مقطعي و يا دائم با توجه به بيماريهاي بومي و غير بومي آبزيان منطقه و ابلاغ آن به شهرستانهاي تابعه, ادارت و ارگانهاي ذيربط بمنظور اعمال در نقل و انتقال آبزيان زنده يا صيد شده ,‌تخم چشم زده و يا لارو.
14ـ اعزام كارشناسان به دوره هاي كوتاه مدت و بلند مدت تخصصي مبارزه با بيماريهاي آبزيان بمنظور دستيابي به آخرين تكنولوژي علمي در اين زمينه
15ـ برنامه ريزي تاسيس و تجهيز آزمايشگاه تشخيص بيماريهاي آبزيان با همكاري ساير قسمتهاي اداره كل دامپزشكي استان , استاندارد كردن و بروز كردن آزمايشات لازم در اين مراكز.
16ـ ايجاد سيستم مراقبت از بيماريهاي آبزيان منطقه منطبق با نظام مديريتي دفتر بهداشت و بيماريهاي آبزيان سازمان مركزي
17ـ جمع آوري و ارسال گزارشات بيماريهاي اخطار شدني و غير اخطار شدني آبزيان منطقه
18ـ شركت در جلسات و كميته هاي تخصصي آبزيان در سطح ادارات و ارگانهاي ذيربط منطقه